Je m’appelle Coralie Rousseau, je suis actuellement en postdoctorat à l’Université de Chicago (Eric and Wendy Schmidt AI in Science Postdoctoral Fellow) où je travaille étroitement avec les Dr Cathy Pfister (département Ecologie et Evolution) et Claire Donnat (Département de Statistiques). J’ai obtenu mon diplôme de docteure en microbiologie en Mars 2025, à la Station Biologique de Roscoff (Bretagne, France) où j’ai été supervisée par les Dr Simon Dittami et Catherine Leblanc. Lors de mon doctorat, j’ai étudié les rôles écologiques et fonctionnelles des communautés microbiennes associées à l’algue brune Ascophyllum nodosum.
Les algues abritent une riche communauté microbienne, comprenant des bactéries, des archées, des virus, des champignons et d’autres eucaryotes à leur surface et dans leurs tissus. L’association entre l’hôte et les microbes forme une entité fonctionnelle dynamique appelée holobionte. Les partenaires microbiens jouent un rôle crucial dans la santé des algues en produisant des composés bioactifs essentiels à la morphologie, au développement et à l’acclimatation physiologique normaux. Malgré les progrès récents et l’intérêt croissant pour ce sujet, notre compréhension du rôle de ces microbes dans la santé de leur hôte reste limitée, principalement en raison de la haute dimensionnalité des données, avec des milliers de caractéristiques pour un nombre relativement faible d’échantillons. Mon projet postdoctoral vise à relever ce défi à travers trois objectifs principaux : premièrement, réduire la dimensionnalité des données afin de mettre au jour des états écologiques cachés ; deuxièmement, cartographier les interactions microbiennes et révéler les relations fonctionnelles émergentes au sein de l’holobionte ; et troisièmement, prévoir les changements dans la structure des communautés microbiennes et identifier les espèces clés qui influencent de manière disproportionnée la santé de l’hôte. Grâce aux méthodes développées, cette recherche fournira une base pour des investigations empiriques plus approfondies sur la contribution des microbes à la santé et à la résilience de l’hôte.
Je souhaite remercier la Société Phycologique de France (SPF) de m’accorder cette bourse qui me permettra de présenter mon projet au congrès ISME20 du 16 au 21 août 2026.
