Je m’appelle Florent, je suis doctorant en 4ème année et je travaille sous la direction d’Helena Cruz de Carvalho, dans les laboratoires de Chris Bowler à l’Institut de Biologie de l’ENS (IBENS). J’ai un fort intérêt pour la biologie moléculaire et la génétique, ce qui m’a amené à travailler sur le génome non codant de l’espèce de diatomée modèle de l’équipe, Phaeodactylum tricornutum. Pendant mon doctorat, je me suis concentrée sur l’optimisation du système CRISPR-Cas9 en utilisant une approche à double guide ARN pour générer des souches mutantes de diatomées. Pour ce faire, j’ai utilisé la capacité des diatomées à subir une conjugaison bactérienne, qui fournit une approche élégante et « propre » pour insérer du matériel génétique à l’intérieur des cellules. Cela m’a permis de générer une banque de mutants de diatomées KO de longs ARN non codants (lncRNA), précédemment identifiés comme étant spécifiquement régulés par l’appauvrissement en phosphate. Parallèlement, j’ai utilisé une approche transcriptomique globale pour comprendre les réponses d’acclimatation à court et à long terme de Phaeodactylum aux changements drastiques de salinité dans l’environnement. Cela a permis d’obtenir des informations approfondies sur les profils d’expression très spécifiques des lncRNA, renforçant ainsi leur rôle régulateur supposé dans l’acclimatation des diatomées à un environnement changeant.
Global transcriptome of short- and long-term hyposaline acclimation in a marine diatom: links to the non-coding genome